Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tuba8Q9JJZ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Tuba8Q9JJZ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tuba8Q9JJZ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms