Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms