Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacng4Q9JJV4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacng4Q9JJV4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms