Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms