Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sv2aQ9JIS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sv2aQ9JIS5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms