Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgi1Q9JIA1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgi1Q9JIA1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms