Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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