Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tcirg1Q9JHF5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms