Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pgpep1Q9ESW8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pgpep1Q9ESW8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms