Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms