Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ropn1Q9ESG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms