Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OtofQ9ESF1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OtofQ9ESF1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms