Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hipk3Q9ERH7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hipk3Q9ERH7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms