Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ParvgQ9ERD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ParvgQ9ERD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms