Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap29Q9ERB0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms