Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Yipf5Q9EQQ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Yipf5Q9EQQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms