Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms