Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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