Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms