Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aph1cQ9DCZ9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms