Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MNCb-2875Q9DCB3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MNCb-2875Q9DCB3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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