Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne8Q9DC53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne8Q9DC53 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms