Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med29Q9DB91 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med29Q9DB91 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms