Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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