Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Erv3Q9DAX3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms