Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smim23Q9DAL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim23Q9DAL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms