Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ift43Q9DA69 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ift43Q9DA69 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ift43Q9DA69 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ift43Q9DA69 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ift43Q9DA69 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ift43Q9DA69 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ift43Q9DA69 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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