Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd9Q9D9M4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd9Q9D9M4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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