Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E9

1700086D15Rik, RIKEN cDNA 1700086D15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700086D15RikQ9D9E9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700086D15RikQ9D9E9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms