Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntd1Q9D995 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms