Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erp27Q9D8U3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Erp27Q9D8U3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms