Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl4Q9D8E6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl4Q9D8E6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms