Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms