Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp5Q9D7S9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms