Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem54Q9D7S1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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