Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3bl1Q9D701 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms