Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc52a3Q9D6X5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms