Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms