Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cmtm5Q9D6G9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms