Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms