Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms