Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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Rab11fip1Q9D620 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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