Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms