Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms