Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrameQ9D4Z5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms