Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms