Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syce1Q9D495 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms