Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D454 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D454 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D454 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D454 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D454 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D454 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D454 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D454 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D454 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D454 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D454 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D454 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms