Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933421I07RikQ9D420 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933421I07RikQ9D420 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms