Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpn3Q9D3W4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms